精液的生化检查目前开展较多的是果糖、酸性磷酸酶、柠檬酸、蛋白质、微量元素、乳酸脱氢酶X等。
做精液的生化检查时，精液标本要置于35℃～37℃水浴箱内，液化后取1.2～1.5ml离心15 分钟，取上层精浆作生化测定。
(1)果糖的测定：一般用间苯二酚法，正常值为256±104mg/dl。果糖主要由精囊分泌，为精子能量代谢的主要来源，与精子活率有关。果糖为零，应考虑精囊缺如。精囊有炎症时，果糖含量下降。此外，雄激素不足及老年时果糖含量降低，糖尿病时精浆中果糖含量较高。
(2)酸性磷酸酶：用β甘油磷酸法测定。正常值为882±412布氏单位/ml。该酶主要来自前列腺。与精子的活力和代谢有关。前列腺炎时，精浆中酸性磷酸酶含量下降；早期前列腺癌或良性前列腺肥大，酸性磷酶含量常增高。
(3)柠檬酸：通过Furthherrmann反应测定，正常值为5 6±2.0mg/dl，主要来自前列腺，调节精液中钙离子浓度，影响精液的液化，具有前列腺酸性磷酸酶激活剂作用，从而影响精子活力。前列腺有炎症时，柠檬酸含量显著减少。
(4)蛋白质：用双缩尿法测定。正常人为3.6±0.8g/dl。精液中的蛋白质主要来自精囊、前列腺，可促进精子活力，保护精子免受环境的有害作用。
(5)微量元素：对男性生殖和生殖内分泌功能有重要作用。正常精液中锌为130±5 6μg/ml ，铜：1.85±0.15μg/ml，铁：0.81±0 04μg/ml。精液中的锌能影响精子代谢，和精子活动力、密度成正比关系，且能通过影响脑垂体再间接地影响性腺，当锌不足时，垂体促性腺激素分泌减少，使性腺发育不良，或使性腺的生殖和内分泌功能发生障碍。铜能影响精子存活率及活动度，精液中铜浓度高，精子活动度较差。反之，则良好。铁与精液中精子密度有明显关系，精浆中含铁则精子密度较高，反之，精子密度低。
(6)精子特异性酶—乳酸脱氢酶X(LDHX)、LDH同功酶具有相对的组织特异性，与生精功能有一定关系。服用生棉籽油过多时的男性不育症患者此酶降低。